治疗扁平疣有效的药膏主要有维A酸乳膏、水杨酸软膏、咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶软膏等。对于扁平疣患者，在使用药膏治疗时，要注意保持皮肤清洁干燥，避免搔抓疣体，以防引起自身接种传播，导致疣体数量增多。
1、维A酸乳膏：维A酸乳膏可以调节表皮细胞的有丝分裂和更新，使病变部位的表皮细胞分化恢复正常，促进表皮细胞的脱落，从而达到去除扁平疣的目的。同时，还能抑制角质形成细胞的增殖，减少角质堆积，对扁平疣引起的皮肤粗糙、角化有改善作用，有助于疣体的消退。
2、水杨酸软膏：水杨酸具有角质溶解作用，可以使角质层细胞间的连接松散，促使角质层脱落，让疣体逐渐剥脱。此外，水杨酸还有一定的抗炎作用，能够减轻扁平疣周围皮肤的炎症反应，对于疣体较小、数量较少的扁平疣有较好的治疗效果。
3、咪喹莫特乳膏：咪喹莫特乳膏是一种免疫调节剂，可以诱导机体产生多种细胞因子，如干扰素等，从而激活免疫细胞，增强机体对人乳头瘤病毒的免疫反应，使免疫系统能够更好地识别和清除感染HPV的细胞，达到治疗扁平疣的目的。
4、氟尿嘧啶软膏：氟尿嘧啶是一种抗代谢药物，可以干扰DNA的合成，抑制疣体细胞的增殖，从而使疣体逐渐萎缩、脱落。但使用过程中可能会出现局部皮肤红肿、疼痛、色素沉着等不良反应。一般适用于疣体较大、其他治疗效果不佳的情况。
同时，要按照医生的建议正确使用药膏，不要自行增减药量或停药。治疗期间应注意观察皮肤反应，如出现红肿、疼痛等严重不良反应，应及时就医。
