生殖器疱疹严重程度不能一概而论。在症状较轻且免疫力正常的情况下，生殖器疱疹通常不算严重，患者可通过自身调节及适当治疗缓解症状；然而，对于免疫力低下人群或出现严重并发症时，生殖器疱疹则可能带来较为严重的后果。
- 多数初次感染生殖器疱疹的患者，症状相对较轻。典型表现为外生殖器或肛门周围出现群簇或散在的小水疱，2-4天后破溃形成糜烂或浅溃疡，自觉疼痛，然后结痂自愈，整个病程一般为2-3周。部分患者仅出现轻微的皮肤症状，无明显全身不适，如发热、头痛、乏力等症状。在这种情况下，疱疹病毒对身体的损害相对局限，通过适当休息、保持局部清洁干燥，配合外用抗病毒药膏等，病情可得到有效控制，对日常生活和健康的影响较小，不会留下严重的后遗症。而且，随着身体免疫力的恢复，疱疹复发的频率也可能逐渐降低。
- 对于免疫力低下的人群，如艾滋病患者、长期使用免疫抑制剂的人群，生殖器疱疹病情往往较为严重。疱疹不仅症状持续时间长，溃疡不易愈合，还可能频繁复发。严重时，病毒可播散至全身，引发疱疹性脑膜炎、脊髓脊神经根病等严重并发症，这些并发症会影响神经系统功能，导致头痛、呕吐、颈项强直、肢体无力等症状，甚至危及生命。此外，孕妇若感染生殖器疱疹，在分娩过程中，病毒可能传染给新生儿，引起新生儿疱疹，这是一种严重的疾病，可导致新生儿出现皮肤疱疹、眼结膜炎、脑炎等，病死率较高，存活者也可能遗留严重的神经系统后遗症，对新生儿的健康成长造成极大威胁。
一旦确诊生殖器疱疹，应及时就医。症状较轻者，可遵医嘱口服阿昔洛韦、伐昔洛韦等抗病毒药物；同时，还可外用药物（如阿昔洛韦乳膏）促进创面愈合。。对于病情严重或免疫力低下者，需住院治疗，密切监测病情变化，加强支持治疗，提高免疫力。
