对于部分相对轻微的染色体异常类型，借助现代医学手段，是能够生育健康后代的；然而，若染色体异常严重，涉及关键基因或染色体结构的重大改变，那么生育正常孩子会面临极大挑战，甚至几乎无法实现。
- 当男方染色体异常为平衡易位、罗氏易位等部分类型时，存在生育可能性。以平衡易位为例，虽然染色体发生了片段交换，但遗传物质总量未改变。这类男性自身表型可能正常，只是在精子形成过程中，会产生多种染色体组合的精子。通过胚胎植入前遗传学诊断（PGD）技术，可对体外受精形成的胚胎进行染色体检测，挑选出染色体正常或携带平衡易位但不影响胚胎发育的胚胎进行移植，从而实现生育健康孩子的目的。同样，对于罗氏易位男性，若夫妻双方充分了解风险，在医生指导下，经过多次尝试或借助辅助生殖技术，也有机会生育正常后代。
- 若男方染色体异常表现为严重的染色体数目异常，如克氏综合征（47，XXY），或大片段的染色体缺失、重复、倒位等，生育健康孩子的难度极大。克氏综合征患者，睾丸发育不全，精子生成严重障碍，大多无法自然受孕，即便通过辅助生殖技术，找到正常精子的概率也极低。而大片段的染色体缺失、重复，会导致大量基因功能异常，所形成的胚胎极有可能出现严重的先天性畸形、智力低下等问题，往往在孕期就会自然流产，难以存活至分娩。
男方若怀疑染色体异常，应及时到正规医院进行染色体核型分析等检查明确诊断。若为可干预的染色体异常类型，可与生殖医学医师沟通，制定个性化的方案。备孕期间，夫妻双方都要保持健康生活方式，戒烟戒酒，避免接触有毒有害物质。
