传染性软疣长在阴囊上可通过疣体夹除、药物治疗、物理治疗等方法处理。对于阴囊上的传染性软疣，患者要注意个人卫生，保持阴囊部位清洁干燥，避免搔抓、摩擦疣体，以防继发感染。
1、疣体夹除：医生会使用镊子等器械将软疣小体完全挤出或挑除，然后局部涂抹碘酊等消毒药水，以防止感染。该方法针对性强，能直接去除疣体，但可能会给患者带来一定的疼痛。
2、药物治疗：可使用维A酸软膏和水杨酸软膏。维A酸软膏可调节表皮细胞分化、改善毛囊皮脂腺导管角化，有助于疣体的消退。水杨酸软膏具有角质溶解作用，能使疣体逐渐脱落。这两种药物通常需按疗程使用，涂抹于疣体表面。
3、物理治疗：冷冻治疗是利用低温使疣体组织坏死脱落，一般采用液氮进行冷冻。激光治疗则是通过激光的热效应精准破坏疣体组织，使其气化、碳化。这两种方法都能有效去除疣体，但可能需要多次治疗，且治疗后局部可能会出现红肿、水疱等反应。
治疗期间应勤换内裤，对内裤及个人用品进行消毒，如煮沸或暴晒，以减少病毒传播的机会。同时，要避免性生活，直至疣体完全消失，防止传染给性伴侣。如果疣体数量较多、体积较大或经过自行处理后症状未见明显改善，应及时就医。
