生殖器感染患者可口服阿奇霉素、甲硝唑、氟康唑等药物进行辅助治疗，建议患者先就医明确病原体，随后在医生指导下合理选用药物。
1、阿奇霉素：阿奇霉素能与细菌核糖体50S亚基结合，阻断细菌蛋白质合成。主要适用于衣原体、支原体等非淋菌性病原体引起的生殖器感染。常见副作用为胃肠道不适，如恶心、呕吐、腹痛、腹泻等，这是因为药物刺激胃肠道平滑肌，干扰了胃肠蠕动。
2、甲硝唑：在无氧环境下，甲硝唑被还原，其还原产物与细菌DNA结合，可破坏DNA结构与功能，抑制细菌生长，尤其对厌氧菌作用显著。适用于厌氧菌引发的生殖器感染。副作用方面，常见胃肠道反应，如恶心、呕吐、食欲不振，还可能出现头痛、眩晕等神经系统症状，少数人会感觉口腔有金属味。长期大量使用可能影响血液系统，需关注血常规变化。
3、氟康唑：氟康唑选择性抑制真菌细胞色素P450酶，干扰真菌细胞膜麦角固醇合成，破坏细胞膜完整性，导致细胞内物质渗漏，抑制真菌生长。适用于念珠菌等真菌感染引起的生殖器疾病。部分患者使用后有胃肠道反应，如腹痛、腹泻、恶心、呕吐。少数人会出现过敏反应，表现为皮疹，严重时可出现剥脱性皮炎，需立即停药就医。长期应用可能影响肝功能，需定期监测。
治疗期间患者需严格按医嘱服药，不能自行增减药量或停药。另外，保持生殖器清洁，每日用温水清洗，勿用刺激性清洁剂。同时，治疗期间避免性生活，防止交叉感染或加重病情。若症状未缓解甚至加重，及时复诊。
