巧克力囊肿并非绝对不能怀孕，但其会对怀孕产生不同程度的影响。巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种，内膜细胞本该生长在子宫腔内，却在卵巢等部位异常生长并形成囊肿。
- 从解剖结构上看，随着巧克力囊肿体积增大，会产生占位效应，压迫周围组织，其中就包括输卵管。输卵管一旦受压，管腔可能变窄甚至堵塞，阻碍精子与卵子相遇结合，使受孕通道受阻。从内分泌角度而言，巧克力囊肿会影响卵巢的正常内分泌功能。卵巢负责分泌雌激素、孕激素等多种激素，这些激素对于维持正常月经周期、促进卵泡发育和排卵至关重要。巧克力囊肿的存在可导致激素分泌失衡，影响卵泡的生长、成熟和排出，使得排卵异常，降低受孕可能性。此外，巧克力囊肿患者的盆腔环境往往较为复杂，常伴有盆腔粘连，这会改变输卵管和卵巢的正常位置及活动度，不利于精卵结合及受精卵的运输。
- 但是，部分巧克力囊肿患者仍具备怀孕的可能。若囊肿体积较小，对周围组织压迫不明显，输卵管保持通畅，卵巢内分泌及排卵功能未受严重影响，患者仍有自然受孕的机会。另外，即使巧克力囊肿对生殖功能有一定影响，通过积极治疗，如手术剥除囊肿，改善盆腔内环境，恢复输卵管和卵巢的正常结构与功能，也能提高受孕几率。还有辅助生殖技术作为有力支持，对于经过治疗后仍难以自然受孕的患者，可通过体外受精-胚胎移植等方式，帮助实现怀孕。
如果患者发现巧克力囊肿，建议先评估囊肿大小、位置及对生殖功能的影响。若囊肿较小、症状不明显且有生育需求，可先观察，定期复查超声，同时监测排卵遵医嘱进行同房。若囊肿较大或症状严重，考虑手术治疗，如卵巢囊肿剔除术。
