支原体咳嗽通常可大致分为四个阶段，总病程一般在2-3周左右。对于支原体咳嗽患者，建议及时就医明确诊断，一旦确诊，严格遵医嘱进行治疗，切勿自行增减药量或停药。
- 潜伏期时，患者感染支原体后可能没有明显症状，但体内支原体已经开始繁殖。多数患者在潜伏期后进入咳嗽早期，此时咳嗽症状较轻微，多为偶尔的干咳，一般持续1-2天。随后病情进展到咳嗽加重期，咳嗽程度加剧，转为频繁的刺激性干咳，部分患者可能伴有少量白痰，这一阶段因支原体持续刺激呼吸道，免疫反应活跃，所以持续时间较长，约1周左右。最后进入缓解期，随着机体免疫系统对支原体的清除以及治疗作用，咳嗽症状逐渐减轻，直至消失，通常需要1-2周。
- 多种因素会影响这四个阶段的时间区间。患者自身免疫力是关键因素，免疫力较强者，身体清除支原体的能力较好，病程可能相对缩短，各阶段时间都会相应减少；而免疫力低下人群，如老年人、儿童或本身患有基础疾病者，免疫系统对抗支原体的过程缓慢，咳嗽各阶段可能都会延长。此外，环境因素也有影响，长期处于空气污染严重、寒冷或潮湿环境中，呼吸道持续受到不良刺激，会阻碍病情恢复，使咳嗽缓解期延长。
患病期间注意休息，保持室内空气流通，温度和湿度适宜，减少呼吸道刺激。同时，避免前往人员密集场所，防止交叉感染，促进病情尽快恢复。
