药物流产的伤害相对较小，其避免了手术流产可能带来的器械损伤。不过，药物流产并非毫无伤害，建议患者谨慎考虑是否终止妊娠。
- 药物流产主要通过遵医嘱口服米非司酮和米索前列醇，前者使子宫蜕膜变性坏死、宫颈软化，后者促使子宫收缩，迫使胚胎排出体外。相较于手术流产，如人工流产术，无需使用器械进入宫腔操作，从而减少了对子宫内膜的直接机械性损伤。在正常情况下，药物流产后，子宫内膜虽有一定程度的脱落，但相对手术刮宫更为轻微，子宫恢复相对较快。一般来说，只要流产过程顺利，没有残留组织，子宫可在较短时间内基本恢复至孕前状态，对未来生育功能的潜在影响相对较小。
- 尽管药物流产对子宫的直接损伤相对小，但仍存在其他风险。药物流产的不完全流产率约为10%-20%，若胚胎组织未能完全排出，残留组织在宫腔内可能引发长时间出血，甚至大出血，需要再次清宫，这不仅会增加患者痛苦，还可能因二次操作对子宫造成额外伤害。此外，药物流产使用的药物可能引起恶心、呕吐、腹痛、腹泻等胃肠道反应，部分女性对药物过敏，可能出现皮疹、瘙痒等过敏症状。而且，流产后女性身体抵抗力下降，若不注意卫生，易引发感染，如子宫内膜炎、盆腔炎等，影响生殖健康。
若决定进行药物流产，患者务必在医生指导下进行。流产前需完善相关检查，如超声、血常规、凝血功能等。用药过程中，密切观察出血及孕囊排出情况，若出血量大或长时间出血不止，及时就医。
