HPV31属于高危型人乳头瘤病毒，目前虽无特效药物直接杀灭该病毒，但可通过一些药物调节机体免疫功能，辅助清除病毒，主要包括人干扰素α2b凝胶与胸腺肽肠溶片、氟尿嘧啶乳膏、保妇康栓等。需注意，药物均需遵医嘱使用。
1、人干扰素α2b凝胶与胸腺肽肠溶片：人干扰素α2b凝胶通过与细胞表面的特异性膜受体结合，激活细胞内抗病毒蛋白基因，产生抗病毒蛋白，从而发挥抗病毒、调节免疫等作用。胸腺肽肠溶片也可调节细胞免疫，促进T淋巴细胞的成熟，提高身体对病毒的抵抗力，有助于HPV31感染的恢复。
2、氟尿嘧啶乳膏：氟尿嘧啶乳膏在一定程度上可用于HPV相关病变的治疗。其能抑制病毒DNA合成，干扰病毒复制，对HPV31感染引起的皮肤、黏膜病变，如尖锐湿疣等有一定治疗效果。不过，其使用可能会引起局部皮肤刺激等不良反应。
3、保妇康栓：其由莪术油、冰片等中药成分组成，具有行气破瘀、生肌止痛的功效，对HPV 31感染的宫颈病变有一定辅助治疗作用，可改善局部症状，促进病变修复。
对于感染HPV31的患者，日常应保持良好的生活习惯。注意个人卫生，尤其是性生活卫生，避免交叉感染。保持规律作息，避免熬夜，保证充足睡眠。定期进行复查，包括HPV检测、TCT等，以便及时了解病情变化。若出现阴道异常出血、白带异常、疣体等症状，应及时就医。
