治疗尖锐湿疣可采用外用药物、免疫调节剂、中药制剂等，从不同角度抑制病毒、去除疣体、预防复发。这些药物均需遵医嘱使用。
1、外用药物：鬼臼毒素酊是常用的外用治疗药物，能抑制微管聚合，干扰细胞有丝分裂，促使疣体组织坏死、脱落，适用于疣体直径较小、数目较少的情况。咪喹莫特乳膏通过诱导机体产生干扰素等细胞因子，激活免疫细胞，增强机体对人乳头瘤病毒的免疫应答，抑制病毒复制，促使疣体逐渐消退，通常需持续使用一段时间以达到较好疗效。
2、免疫调节剂：人干扰素α2b凝胶可激活细胞内抗病毒蛋白基因，产生抗病毒蛋白，抑制HPV复制，同时调节机体免疫功能，增强免疫细胞对感染HPV细胞的识别和杀伤能力，常局部涂抹于疣体及周围皮肤，辅助清除病毒，降低复发风险。胸腺肽肠溶片能促进T淋巴细胞的成熟和分化，增强机体细胞免疫功能，提高身体对HPV病毒的抵抗力，可作为尖锐湿疣综合治疗的辅助用药。
3、中药制剂：五妙水仙膏由黄柏、紫草、五倍子等多种中药制成，具有清热解毒、祛腐生新的功效，涂抹于疣体可使疣体组织凝固、坏死、脱落，同时调节局部免疫功能，促进伤口修复。三黄膏主要成分有黄柏、黄芩、黄连等，具有清热解毒、消肿止痛的功效，通常可用于治疗疮疡初起、红肿热痛等症状，可以辅助治疗尖锐湿疣。
治疗尖锐湿疣期间，应保持患处清洁干燥，避免搔抓，防止疣体破损引发病毒扩散或感染。若出现新疣体或原有症状加重，应及时就医，在医生指导下调整治疗方案，不可自行随意用药。
