生殖器感染真菌的处理方式主要包括局部药物治疗、全身药物治疗、日常清洁护理等。建议定期复查，监测病情变化。
1、局部药物治疗：遵医嘱局部药物治疗通过直接作用于感染部位抑制或杀灭真菌。常用药物有克霉唑乳膏、硝呋太尔制霉菌素阴道软膏等。克霉唑能抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成，增加细胞膜通透性，导致真菌细胞内重要物质外漏而死亡；制霉菌素可与真菌细胞膜上的甾醇相结合，改变细胞膜的通透性，使细胞内物质泄漏，达到抑菌和杀菌效果。
2、全身药物治疗：在医生指导下采用全身药物治疗适用于局部治疗效果不佳、病情严重或复发性感染的情况。常用药物如氟康唑、伊曲康唑等。氟康唑可高度选择性地抑制真菌细胞色素P450酶，使真菌细胞膜的麦角固醇合成受阻，导致细胞膜通透性改变，抑制真菌生长繁殖；伊曲康唑能抑制真菌细胞膜上麦角固醇的合成，影响细胞膜功能，发挥广谱抗真菌作用。
3、日常清洁护理：每日使用温水清洗生殖器，避免使用刺激性清洁剂破坏局部微生态；清洗时轻柔擦拭，避免损伤皮肤黏膜。男性应翻转包皮彻底清洁包皮垢，女性在经期更要注意卫生，勤换卫生巾。清洗后的内裤需选择棉质、透气材质，并单独清洗，用开水烫洗后在阳光下充分暴晒，利用高温和紫外线杀灭残留真菌。
建议确诊生殖器真菌感染后，及时前往正规医院皮肤科或泌尿外科就诊。严格遵医嘱用药，无论是局部还是全身用药，均需完成规定疗程，不可擅自停药。治疗期间避免性生活，保持生殖器清洁干燥，防止感染加重或扩散。
