子宫卵巢囊肿对怀孕的影响不一，小的生理性囊肿一般不影响，通常能正常受孕；但大囊肿或病理性囊肿，可能会压迫输卵管、影响卵巢排卵，改变盆腔微环境，阻碍受孕。
- 如果囊肿较小，例如直径小于5厘米，且为生理性囊肿，如常见的黄体囊肿等，通常会随着月经周期自行消失。在这种情况下，囊肿对卵巢的正常排卵功能以及子宫的内环境基本没有影响，输卵管也能保持通畅，精子可以顺利通过输卵管与卵子结合，受精卵也能够在子宫内正常着床和发育，所以患者依然有正常受孕的机会，怀孕过程也通常不会因囊肿受到明显干扰。
- 然而，当囊肿体积较大时，可能会压迫周围组织，若压迫到输卵管，就会阻碍精子和卵子的结合，或者影响受精卵向子宫腔内的运输，导致受孕困难。若是囊肿影响了卵巢的正常结构和功能，使排卵出现异常，如不排卵或排卵时间紊乱，也会降低受孕几率。而且某些病理性囊肿，如巧克力囊肿，会改变盆腔内的微环境，产生一些炎性介质，这些介质不利于精子的存活和运动，还可能干扰受精卵的着床。
针对子宫卵巢囊肿与怀孕的问题，建议计划怀孕的女性，在备孕前一定要进行全面的妇科检查，包括超声检查等，以明确囊肿的大小、性质、位置等情况。如果囊肿较小且考虑为生理性囊肿，可在医生的指导下先尝试备孕，并定期复查囊肿变化。若囊肿较大或高度怀疑为病理性囊肿，应积极配合医生进行治疗，待囊肿得到有效控制或治愈后，再根据医生的建议备孕。
